与巴氏加热杀菌法比较，微波杀菌有以下显著特点:

　　一、微波杀菌是一种物理杀菌方法，不需要添加任何化学产品就能够杀菌，而且不会对食品产生放射性物质的污染，也不会残留毒性，安全无害。对于食品原有的色香味以及营养成分也不会造成任何破坏。

　　二、同样温度下，所需杀菌时间短，不需要预热。且杀菌效果极为显著。

　　三、能同时对物料表里实施整体杀菌，极大地缩短杀菌周期，并保证杀菌一致性。这一特性能避免因长时间的加热影响食品品质，特别适用于不宜在较高温度或较长时间情况下进行杀菌的食品。例如:易挥发香辛成分的姜粉、含水分较多的鲜嫩海蛰等。对于既要保持色泽、香味和口感不变等质量要求又需杀菌的物料，使用微波杀菌可取得最佳效果。

　　四、微波杀菌可分为包装后杀菌和包装前杀菌。包装容器不能用金属质地的，需用介质材料，一般用塑料软包装或玻璃，工程塑料质地容器为宜。为防止在微波杀菌过程中涨袋，设备可在工作仓内施加压力采用反压杀菌工艺，可防止涨袋损失。

　　微波设备可对已包装、未包装的不同物品进行灭菌加工处理。可用于:1.粮食制品类:面包、月饼、面条、豆腐、豆腐干等。2.蔬菜类:泡菜、竹笋、香菇类等。3.水果类:荔枝、龙眼等。4.奶制品、调味品、香精香料、方便面汤料、火锅调料及各种液体等均可杀菌加工。

　　现微波加热杀菌技术已扩展到制造工业生产用的工业微波加热设备，以满足诸如食品加工行业的食品烹调与加工，杀菌保鲜需要；橡胶硫化、再生胶脱硫；纺织品染色固色；化纤产品定型、干燥脱水；皮草、纸张及化妆品的干燥、杀菌；胶卷等涂层的干燥脱水；烟叶焙烤；中成药材或制品的干燥杀菌；砂型坯模固化干燥、石墨材料、陶瓷的加热等行业需要。许多企业采用微波干燥、灭菌新技术，已经产生了良好的社会经济效益，更多的企业亦将采用微波设备，这一良好的趋势必将促进我国食品、制药、化工等行业的发展。