疾病原因，疾病也是制约小龙虾种苗规格的一个主要原因，尤其以纤毛虫病最为常见。当纤毛虫在虾体上寄生时，会从虾体上吸取营养而使小龙虾身体瘦弱，小龙虾种苗会因为缺乏营养而不能正常脱壳生长；还有当纤毛虫寄生在小龙虾鳃部时会影响小龙虾鳃的呼吸功能，导致小龙虾种苗不能正常呼吸而处于一个长期缺氧的状态，最终小龙虾种苗会因为长期缺氧而不能正常摄食、脱壳和生长，导致规格偏小。另外由于纤毛虫的寄生甚至还会引起小龙虾种苗其它疾病的发生而大量死亡，并且这样的小龙虾进入市场后也没有消费者愿意购买。

　　防治方法:在每年春季的“大麦黄”前一星期左右、“梅雨季节”到来前一星期左右（一般在每年的6月下旬进入梅雨季节）、秋季“白露”前一星期左右分别用药物进行预防，即先用一次杀虫药，隔日再用一次消毒药物即可。夏季高温季节每隔半个月左右交替使用光合细菌和生石灰进行全池泼洒以调节水质，每隔7～10天左右注换一次新水，保持水质清新，每次换水量为原池塘水量的15%～20%左右。

　　水质原因，近几年，由于受气候因素的影响，每年的春季都是干旱少雨，所以大部分养殖户在春季池塘的水位都偏浅，但是随着气温的回升，投饵量的增加，其残饵、粪便以及池中有机物的分解都会给水质带来不良影响，这时又没有新鲜的外源水及时进行注换以调节水质，而水质的好坏将直接影响小龙虾摄食、脱壳和生长，这些都制约着小龙虾的长成规格。