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　　工件在进行电泳加工时，一般是要经过酸洗的，不过最好是进行线外单独酸洗，因为如果采用在线酸洗的话，那么就会带来一些不良影响，其主要有:(1)酸洗所形成的酸雾，会腐蚀相关的机器设备，而且还会危害到人体健康。(2)会降低工件的强度，如果工件上有残留的话，那还会影响到电泳漆膜的耐盐雾性能。(3)酸洗后清洗不干净的话，会影响到电泳槽的稳定性能，会破坏电泳树脂的稳定性。如果长此以往的话，那么就会使电泳槽液报废的。

　　溶液的pH值决定了带电颗粒解离的程度，也决定了物质所带净电荷的多少，对于蛋白质，氨基酸等两性电解质而言，溶液pH值离电点越远，颗粒所带净电荷越多；电泳速度越快；反之则越慢。例如血清中几种主要蛋白质的等电点各不相同，白蛋白等电点是4.0。α2球蛋白等电点是5.06，β球蛋白等电点是5.1，γ球蛋白等电点是7.1。当在pH8.6的电泳缓冲液中电泳时，这些蛋白质都带负电荷，它们的泳动速度是白蛋白β球蛋白>γ球蛋白。因此，当要分离一种蛋白质混合物时，应选择一种能扩大各种蛋白质所带电荷量差异的pH值，以利于各种蛋白质分子的解离。同时，为保持电泳过程中溶液pH恒定也须使用缓冲液。

　　（2）浓度:随着缓冲液离子强度的增加，缓冲液携带的分电流也增加，电流减小，这减慢了样品迁移率。增加缓冲液的离子强度也会增加总电流，因此增加热量的产生。在低离子强度下，缓冲液携带的电流减少，而样品携带的电流增加，从而加速了样品的迁移转移。低离子强度缓冲液可降低总电流，从而减少热量产生，但扩散更为严重，从而导致分离度降低。因此，在选择离子强度时，同时考虑两者。离子强度的一般范围在0.02和0.2之间。离子强度=12∑CZ2，C是离子的摩尔浓度，Z是其携带的电荷。

　　（3）电阻:迁移率与电阻成反比，电阻由支持介质的类型和大小以及缓冲液中的离子决定由强度决定。电阻随着支持介质的长度，支持介质的宽度和缓冲液的离子强度而增加降低。电泳期间，会以A2Ω瓦特的比率产生热量，并且电阻会随着温度的升高而降低。因此，如果电压仍然存在如果没有变化，则温度的升高将导致电流增加，并促进溶剂在载体介质上的蒸发。为了为了获得尽可能可重复的结果，请使用稳定的电源设备，尽管由于温度波动，不可避免地引起电阻变化，但是此电源可以自动保持恒定的电压或电流。盖上盖子电泳槽减少蒸发。电泳槽上装有冷却系统，在高压下工作时起到外部冷却的作用。