上海市胸科医院成立于1957年，由我国老一辈的著名胸心外科专家黄家驷、顾恺时教授等创建，是我国最早成立的一家以治疗胸部疾病为主的专科性医院。建院以来，为我国医疗人才培养、胸部疾病的防治起到了巨大的作用。胸外科也是我国最早开展各类胸部手术的专科，在老前辈吴善芳、黄偶麟、吴松昌等教授的带领下，率先开展了肺叶切除、气管切除重建等高难度手术，为我国胸外科的发展奠定了基础。四十几年来，胸外科在肺部疾病、气管外科、食管良恶性疾病、纵隔肿瘤等方面开展了大量的工作，尤其是近几年在肺癌的综合治疗、食管癌的多学科诊治、胸腺上皮肿瘤的临床病理研究、肺移植及气管移植方面的临床和科研工作中取得了新的成绩，确立了学科在国内的领先地位。 上海市胸科医院胸外科根据该院提出的“打造亚洲一流精品专科医院”的发展规划，近年来经过“上海市医学重点学科建设”项目支撑和医院的大力支持，使得科室得到长足发展。根据该院临床医疗业务为主的特点以及胸外科的手术技术传统优势特色，确立了以发展亚专科带动临床业务、提高医疗质量、加强临床科研、培养相关人才的方向，先后成立了上海市肺部肿瘤临床医学中心、交通大学食管疾病专病临床诊治中心、肺移植中心以及微创外科、纵隔疾病、气管外科亚专业组，予以专项投入和重点扶持，通过购置更新高端和先进的设备以帮助保持医疗技术的领先水准，根据亚专科发展需求引进相应人才、培养学科骨干和后备力量，加大科研项目申报、完成以及科研论文奖励力度，鼓励扶持与临床医疗密切相关的科研计划，行政管理部门积极介入参与单病种临床路径完善与实施，监督住院和门诊合理化用药、抗菌素规范使用情况，强化院内感染预防控制措施，监管降低住院费用，扩建门诊并增设专科、专病门诊,通过各类媒体网络平台介绍专科品牌和技术特色优势，宣传胸外科常见病的预防和诊治方式以及诊疗进展。科室规模不断扩大，布局进一步合理化，临床业务量保持全国领先，服务范围和辐射影响力强，科研成果显著，人才结构渐趋合理。