日本商标注册主管机关为日本专利局(JPO)，其前身是1885年设立的“专卖特许所”，现为隶属于经济产业省的政府机构，现更名为日本专利局(JPO)。

　　注册日本商标时间及流程:

　　1、商标注册申请递交到日本特许厅；

　　2、形式审查阶段:审查申请文件是否齐备，必填项目是否填写完整。如不符合要求，通知申请人更正；

　　3、实质审查阶段:审查商标是否满足实质审查要求；

　　4、通过实质审查，做出允许商标注册的决定；

　　5、未能满足要求者发出驳回理由通知书，申请人对此出具抗辩书或理由书；

　　6、商标注册权确立，商标权开始存在，予以公告，异议期两个月；

　　7、如果抗辩书或理由书不能消除驳回理由，驳回裁定成立；

　　8、对裁定不服可以起诉；

　　9、如果对起诉结果不满，可向东京高级法院提起上诉。如果仍不服，可继续向高级法院提起上诉。