一、在重庆巴南区注册公司，一般需要遵循以下流程:

　　1、公司名称查名:首先，需要通过工商局网站或现场查询，确保所选公司名称不与已注册的名称重复，且不违反相关法规。

　　2、提交材料并申请预先核准名:向巴南区工商行政管理局提交公司名称预先核准申请表，以及相关的身份证明等材料，申请预先核准名。

　　3、办理营业执照:在预先核准名通过后，准备并提交必要的材料（如法定代表人的身份证明、公司章程、股东名册等）以办理营业执照。

　　4、办理税务登记:在营业执照办理完成后，向税务部门提交公司的相关信息和材料，办理税务登记，包括增值税一般纳税人资格申请、企业所得税登记等。

　　5、刻制公章:完成备案信息填写后，前往公安局指定地点刻制公司公章、财务章和法人章。

　　二、在巴南区注册公司时，需要准备以下材料:

　　1、公司名称预先核准申请表:明确公司名称及营业范围。

　　2、法定代表人身份证明:包括身份证复印件、照片等。

　　3、公司章程:规定公司的基本组成结构、管理制度、股东权利以及经营范围等。

　　4、股东身份证明及照片:所有股东的身份证复印件及照片。

　　5、办公地址证明:如房产证、租赁合同等，证明公司注册地址的真实性。

　　6、其他相关材料:根据不同行业和公司类型，可能还需要提供相关的许可证、资质证明等。

　　请注意，以上流程和材料是基于一般情况的概述，实际操作中可能会因具体情况和政策变化而有所不同。因此，在注册公司前，建议详细咨询当地工商行政管理部门或专业机构，以确保流程顺利、材料齐全。